MRI扫描时间减少通常通过并行成像方法实现,通常基于逆图像空间(A.K.A.K空间)的均匀下采样和具有多个接收器线圈的同时信号接收。 Grappa方法通过跨越所有线圈的相邻获取信号的线性组合来插入缺失的k空间信号,并且可以通过k空间中的卷积来描述。最近,介绍了一种称为RAKI的更广泛的方法。 Raki是一种深入学习方法,将Grappa推广到附加的卷积层,在此期间应用非线性激活功能。这使得卷积神经网络能够实现缺失信号的非线性估计。与Grappa类似,Raki中的卷积核心使用从自动校准信号(ACS)获得的特定训练样本进行培训。 Raki与Grappa相比提供了卓越的重建质量,然而,由于其未知参数的数量增加,通常需要更多的AC。为了克服这一限制,本研究调查了训练数据对标准2D成像重建质量的影响,特别关注其金额和对比信息。此外,评估迭代k空间插值方法(araki),包括通过初始的格拉普重建训练数据增强,并通过迭代培训改进卷积滤波器。仅使用18,20和25个ACS线(8%),通过抑制在加速度因子R = 4和r = 5时发生的残余人工制品,并且与Grappa相比,通过定量质量指标加下划线,产生强烈的噪声抑制。与相约束的组合进一步改善。此外,在预扫描校准的情况下,伊拉克基显示比GRAPPA和RAKI更好的性能,并且在训练和缺乏采样的数据之间强烈不同的对比度。
translated by 谷歌翻译
The number of international benchmarking competitions is steadily increasing in various fields of machine learning (ML) research and practice. So far, however, little is known about the common practice as well as bottlenecks faced by the community in tackling the research questions posed. To shed light on the status quo of algorithm development in the specific field of biomedical imaging analysis, we designed an international survey that was issued to all participants of challenges conducted in conjunction with the IEEE ISBI 2021 and MICCAI 2021 conferences (80 competitions in total). The survey covered participants' expertise and working environments, their chosen strategies, as well as algorithm characteristics. A median of 72% challenge participants took part in the survey. According to our results, knowledge exchange was the primary incentive (70%) for participation, while the reception of prize money played only a minor role (16%). While a median of 80 working hours was spent on method development, a large portion of participants stated that they did not have enough time for method development (32%). 25% perceived the infrastructure to be a bottleneck. Overall, 94% of all solutions were deep learning-based. Of these, 84% were based on standard architectures. 43% of the respondents reported that the data samples (e.g., images) were too large to be processed at once. This was most commonly addressed by patch-based training (69%), downsampling (37%), and solving 3D analysis tasks as a series of 2D tasks. K-fold cross-validation on the training set was performed by only 37% of the participants and only 50% of the participants performed ensembling based on multiple identical models (61%) or heterogeneous models (39%). 48% of the respondents applied postprocessing steps.
translated by 谷歌翻译
Artificial Intelligence (AI) is having a tremendous impact across most areas of science. Applications of AI in healthcare have the potential to improve our ability to detect, diagnose, prognose, and intervene on human disease. For AI models to be used clinically, they need to be made safe, reproducible and robust, and the underlying software framework must be aware of the particularities (e.g. geometry, physiology, physics) of medical data being processed. This work introduces MONAI, a freely available, community-supported, and consortium-led PyTorch-based framework for deep learning in healthcare. MONAI extends PyTorch to support medical data, with a particular focus on imaging, and provide purpose-specific AI model architectures, transformations and utilities that streamline the development and deployment of medical AI models. MONAI follows best practices for software-development, providing an easy-to-use, robust, well-documented, and well-tested software framework. MONAI preserves the simple, additive, and compositional approach of its underlying PyTorch libraries. MONAI is being used by and receiving contributions from research, clinical and industrial teams from around the world, who are pursuing applications spanning nearly every aspect of healthcare.
translated by 谷歌翻译
DeepMind的游戏理论与多代理团队研究多学科学习的几个方面,从计算近似值到游戏理论中的基本概念,再到在富裕的空间环境中模拟社会困境,并在困难的团队协调任务中培训3-D类人动物。我们小组的一个签名目的是使用DeepMind在DeepMind中提供的资源和专业知识,以深入强化学习来探索复杂环境中的多代理系统,并使用这些基准来提高我们的理解。在这里,我们总结了我们团队的最新工作,并提出了一种分类法,我们认为这重点介绍了多代理研究中许多重要的开放挑战。
translated by 谷歌翻译
ICECUBE是一种用于检测1 GEV和1 PEV之间大气和天体中微子的光学传感器的立方公斤阵列,该阵列已部署1.45 km至2.45 km的南极的冰盖表面以下1.45 km至2.45 km。来自ICE探测器的事件的分类和重建在ICeCube数据分析中起着核心作用。重建和分类事件是一个挑战,这是由于探测器的几何形状,不均匀的散射和冰中光的吸收,并且低于100 GEV的光,每个事件产生的信号光子数量相对较少。为了应对这一挑战,可以将ICECUBE事件表示为点云图形,并将图形神经网络(GNN)作为分类和重建方法。 GNN能够将中微子事件与宇宙射线背景区分开,对不同的中微子事件类型进行分类,并重建沉积的能量,方向和相互作用顶点。基于仿真,我们提供了1-100 GEV能量范围的比较与当前ICECUBE分析中使用的当前最新最大似然技术,包括已知系统不确定性的影响。对于中微子事件分类,与当前的IceCube方法相比,GNN以固定的假阳性速率(FPR)提高了信号效率的18%。另外,GNN在固定信号效率下将FPR的降低超过8(低于半百分比)。对于能源,方向和相互作用顶点的重建,与当前最大似然技术相比,分辨率平均提高了13%-20%。当在GPU上运行时,GNN能够以几乎是2.7 kHz的中位数ICECUBE触发速率的速率处理ICECUBE事件,这打开了在在线搜索瞬态事件中使用低能量中微子的可能性。
translated by 谷歌翻译
为了识别动态网络中嵌入的系统(模块),必须制定一个多输入估计问题,该问题需要测量某些节点并将其作为预测输入。但是,由于传感器选择和放置问题,在许多实际情况下,其中一些节点可能无法测量。这可能会导致目标模块的偏差估计。此外,与多输入结构相关的识别问题可能需要确定实验者不特别感兴趣的大量参数,并且在大型网络中的计算复杂性增加。在本文中,我们通过使用数据增强策略来解决这些问题,该策略使我们能够重建缺失的节点测量并提高估计目标模块的准确性。为此,我们使用基于正规化的基于内核的方法和近似推理方法开发了系统识别方法。为感兴趣的模块保留一个参数模型,我们将其他模块作为高斯过程(GP)建模,并用所谓的稳定样条核给出的内核。经验贝叶斯(EB)方法用于估计目标模块的参数。相关的优化问题是使用预期最大化(EM)方法来解决的,在该方法中,我们采用马尔可夫链蒙特卡洛(MCMC)技术来重建未知的缺失节点信息和网络动力学。动态网络示例上的数值模拟说明了开发方法的电势。
translated by 谷歌翻译
基于变压器的模型的出现,机器翻译已经快速发展。这些模型没有内置的明确的语言结构,但是它们仍然可以通过参与相关令牌隐式学习结构化的关系。我们假设通过明确赋予变形金刚具有结构性偏见,可以使这种结构学习变得更加健壮,我们研究了两种在这种偏见中构建的方法。一种方法,即TP变换器,可以增强传统的变压器体系结构,包括代表结构的附加组件。第二种方法通过将数据分割为形态令牌化来灌输数据级别的结构。我们测试了这些方法从英语翻译成土耳其语和Inuktitut的形态丰富的语言,并考虑自动指标和人类评估。我们发现,这两种方法中每种方法都允许网络实现更好的性能,但是此改进取决于数据集的大小。总而言之,结构编码方法使变压器更具样本效率,从而使它们能够从少量数据中表现得更好。
translated by 谷歌翻译
骨肉瘤是最常见的原发性骨癌,其标准治疗包括术前化疗,然后切除。化学疗法反应用于预测患者的预后和进一步治疗。坏死在切除标本上的组织学幻灯片通常评估了坏死比定义为坏死肿瘤与总体肿瘤之比。已知坏死比> = 90%的患者的预后更好。多个载玻片对坏死比的手动微观综述是半定量性的,并且可能具有观察者间和观察者间的变异性。我们提出了一种基于目标和可再现的深度学习方法,以估计坏死比,并从扫描的苏木精和曙红全幻灯片图像预测结果。我们以3134个WSI的速度收集了103例骨肉瘤病例,以训练我们的深度学习模型,验证坏死比评估并评估结果预测。我们训练了深层多磁化网络,以分割多个组织亚型,包括生存的肿瘤和像素级中的坏死肿瘤,并计算来自多个WSI的病例级坏死比。我们显示了通过分割模型估算的坏死比,高度与由专家手动评估的病理报告中的坏死比高度相关,其中IV级的平均绝对差异(100%),III(> = 90%)和II(> = 50%和<50%和< 90%)坏死反应分别为4.4%,4.5%和17.8%。我们成功地对患者进行了分层,以预测P = 10^-6的总生存率,而P = 0.012的无进展生存率。我们没有可变性的可重现方法使我们能够调整截止阈值,特别是用于模型和数据集的截止阈值,为OS的80%,PFS为60%。我们的研究表明,深度学习可以支持病理学家作为一种客观的工具,可以分析组织学中骨肉瘤,以评估治疗反应并预测患者结果。
translated by 谷歌翻译
可靠性的关键问题是电路设计师的巨大关注之一。驱动力是晶体管老化,取决于操作电压和工作负载。在设计时,很难估算在终生期间保持衰老效果的近距离护罩。这是因为铸造厂不共享其基于物理的校准模型,该模型由高度机密的技术和材料参数组成。但是,对降解的不受监控但必要的高估相当于绩效下降,这是可以预防的。此外,这些基于物理学的模型在计算方面非常复杂。在设计时间为数百万个单个晶体管建模的成本显然是过高的。我们提出了经过培训的机器学习模型的革命前景,以复制基于物理的模型,以免披露机密参数。出于设计优化的目的,电路设计人员可以完全访问这种有效的解决方法。我们证明了模型通过对一个电路的数据进行训练并将其成功应用于基准电路的能力。平均相对误差高达1.7%,速度高达20倍。电路设计师有史以来首次可以易于使用高精度老化模型,这对于有效的设计至关重要。这项工作是跨越铸造厂和电路设计师之间宽阔鸿沟的方向的一个有希望的步骤。
translated by 谷歌翻译
注意缺陷/多动症(ADHD)是一种神经发育障碍,高度流行,需要临床专家才能诊断。众所周知,个人的观察行为反映在眼睛运动中,直接与注意机制和高阶认知过程有关。因此,我们探讨了是否可以根据记录的眼动动作以及在免费观看任务中的视频刺激信息进行检测到多动症。为此,我们开发了一个基于端到端的深度学习序列模型%,该模型%使用眼动扫描路径,我们将其预先培训在相关任务上,该任务可获得更多数据。我们发现该方法实际上能够检测ADHD并胜过相关的基线。我们在消融研究中研究了输入特征的相关性。有趣的是,我们发现该模型的性能与视频内容密切相关,该视频为未来的实验设计提供了见解。
translated by 谷歌翻译